自然资源统一确权登记主要针对国有的自然资源，并以自然资源登记单元(包括国家公园、自然保护区、湿地、水流等)为基础记载自然资源的自然状况、权属状况，以及用途管制、生态保护红线、公共管制和特殊保护要求等限制情况。自然资源统一确权登记以不动产登记为基础开展，对在不动产登记中已经登记的集体土地和自然资源的所有权不再重复登记。

自然资源登记的类型包括首次登记和变更登记。

首次登记是指在一定时间内对登记单元里全部国家所有的自然资源所有权进行的全面登记。自然资源首次登记程序包括通告、调、审核、公告、登簿。登簿完成后，要将自然资源确权登记信息纳入不动产登记信息管理基础平台，与不动产登记信息有效衔接。除涉及国家秘密及《不动产登记暂行条例》规定的不动产登记的相关内容外，自然资源确权登记结果应当向社会公开。

变更登记是指因自然资源的类型、边界等自然资源登记簿内容发生变化而进行的登记。